改造腺嘌呤碱基编辑器扩大了碱基编辑器的效用

2021-08-10 10:16:42

韩国汉阳大学Sangsu Bae、高丽大学Jae-Sung Woo等研究人员合作发现,腺嘌呤碱基编辑器的改造能够减少旁观者胞嘧啶编辑。相关论文近日在线发表于《自然—生物技术》。

研究人员表示,腺嘌呤碱基编辑器(ABE)在感兴趣的基因组位点催化特定的A到G 转换。然而,ABE也会在靶点诱导胞嘧啶脱氨。

为了降低胞嘧啶编辑活性,研究人员设计了一种常用的腺苷脱氨酶TadA7.10,并发现在TadA7.10中具有D108Q突变的ABE7.10表现出降低了十倍的胞嘧啶脱氨活性。D108Q突变还降低了最近开发的两种ABE高活性版本ABE8e和ABE8s中的胞嘧啶脱氨活性,并且与V106W兼容,这是一种减少脱靶RNA编辑的突变。

包含P48R突变的ABE7.10显示出增加的胞嘧啶脱氨活性和显著降低的腺嘌呤编辑率,从而产生用于TC到TT或TC到TG转换的TC特异性碱基编辑工具,从而扩大了碱基编辑器的效用。

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