近日，美国佐治亚大学Robert J. Schmitz、Alexandre P. Marand等研究人员合作绘制出单细胞分辨率的玉米顺式调控图谱。这一研究成果近日在线发表于《细胞》。
通过6种玉米器官中的单细胞基因组学，研究人员鉴定了顺式和反式调节因子，这些因子定义了不同的细胞身份，并介导了染色体组织。细胞类型特异的顺式调控元件(CRE)富含增强子活性，并在未甲基化的长末端重复逆转录转座子中富集。此外，研究人员发现特定于细胞类型的CRE是表型相关遗传变异的热点，并且在现代玉米育种过程中被选择作为目标，从而突出了这个CRE图谱的生物学意义。
通过比较玉米和拟南芥的发育轨迹，研究人员确定了具有保守和不同染色质动力学的TF和CRE，并显示了基因调控网络的广泛进化。除了这个丰富的数据集外，研究人员还开发了单细胞分析软件Socrates，该软件可用于了解任何物种的顺式调控变异。
据悉，CRE编码时空基因表达程序的基因组蓝图，可实现高度专业化的细胞功能。
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