全基因组基因表达细菌适应性的影响互相联系

2021-08-19 10:18:27

美国洛克菲勒大学Jeremy M. Rock和威尔康奈尔医学院Dirk Schnappinger小组合作利用全基因组基因表达调控揭示了结核分枝杆菌 (Mtb)的脆弱性。该项研究成果近日在线发表于《细胞》。

研究人员开发了一种基于CRISPR干扰的功能基因组学方法,以系统地确定结核分枝杆菌中的基因表达并监测细菌的适应性。研究在各种过程中确定了具有高度脆弱性的基因,包括未知的药物新靶点。同时,研究确定了必需的基本基因,这可能解释了药物研发失败的原因。正常和高毒力Mtb分离株之间的脆弱性比较揭示了脆弱性的不完全保护,并且不同的脆弱性可以预测不同的抗菌敏感性。该研究结果定量定义了基本的细菌过程,并发现了具有药物开发潜能的新靶点。

据介绍,抗菌药物靶向必需基因,但很少能实现完全抑菌的目的。因此,利用传统遗传方法得到的对必需基因有或无效的靶点并非是最有吸引力的细菌靶标,因为抑制作用不足反而导致细菌适应性增加。相比之下,基因“脆弱性”是一种连续的、可量化的特征,它把基因的抑制程度与对细菌适应性的影响联系起来。

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